Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF3Q9NR23 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms