Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB3Q9NQW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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