Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCUBE2Q9NQ36 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms