Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG4Q9NPE6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG4Q9NPE6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG4Q9NPE6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms