Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms