Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLSPNQ9HAW4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CLSPNQ9HAW4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLSPNQ9HAW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms