Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG4Q9H9E3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG4Q9H9E3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms