Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIPAS39Q9H9C1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms