Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms