Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XKR8Q9H6D3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms