Protein–RNA interactions for Protein: Q9H322

VCX2, Variable charge X-linked protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX2Q9H322 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCX2Q9H322 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms