Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PARLQ9H300 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms