Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA6AQ9H2E6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA6AQ9H2E6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms