Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIL1Q9H173 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIL1Q9H173 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms