Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH19Q9H159 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms