Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC8Q9H0W5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms