Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms