Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
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LRRC27Q9C0I9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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