Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HIRIP3Q9BW71 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms