Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM106CQ9BVX2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM106CQ9BVX2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms