Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP58Q9BVL2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms