Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms