Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3BQ9BS92 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms