Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FYCO1Q9BQS8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms