Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFA3Q9BQP9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms