Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms