Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNS3Q9BQ31 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms