Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms