Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRNP1Q96S65 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms