Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HHIPQ96QV1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms