Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms