Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA5Q96PV4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNMA5Q96PV4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms