Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIM3Q96PE6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms