Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NECTIN4Q96NY8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN4Q96NY8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN4Q96NY8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN4Q96NY8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN4Q96NY8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN4Q96NY8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN4Q96NY8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms