Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD27Q96NW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD27Q96NW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD27Q96NW4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms