Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD11Q96NU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD11Q96NU1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD11Q96NU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD11Q96NU1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SAMD11Q96NU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms