Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms