Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms