Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf85Q96MD7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms