Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms