Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms