Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms