Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFRP2Q96HF1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFRP2Q96HF1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms