Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF2Q96GP6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms