Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms