Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FBXO17Q96EF6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXO17Q96EF6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms