Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHISA4Q96DD7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms