Protein–RNA interactions for Protein: Q96C01

FAM136A, Protein FAM136A, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM136AQ96C01 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM136AQ96C01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM136AQ96C01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM136AQ96C01 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM136AQ96C01 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM136AQ96C01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM136AQ96C01 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM136AQ96C01 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM136AQ96C01 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM136AQ96C01 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM136AQ96C01 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms