Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms