Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTSSAQ969W0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTSSAQ969W0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms